Игорь Баканов родился в 1966 году в Фергане (Узбекистан). В 1982–1987 гг. обучался в Ленинградском музыкальном училище имени М. П. Мусоргского, в 1988 году поступил в Ленинградскую государственную консерваторию имени Н. А. Римского-Корсакова, в дальнейшем перевелся в Московскую государственную консерваторию имени П. И. Чайковского, в 1998 году окончил аспирантуру МГК.
Лауреат Всесоюзного конкурса в Харькове (1990, I премия), I Международного конкурса «Нижний Новгород – Брасс» (1994, II премия).
В 1994–1996 гг. – артист Государственной академической симфонической капеллы под управлением Валерия Полянского, в 1993–2003 гг. – Российского государственного симфонического оркестра кинематографии, в 1996–2004 гг. – Российского национального оркестра. С 2004 года – артист Национального филармонического оркестра России.
Ведет педагогическую деятельность, преподает в Центральной музыкальной школе – Академии исполнительского искусства (доцент), регулярно проводит мастер-классы в образовательном центре «Сириус» и других городах России.
В 2024 году был удостоен Благодарности министра культуры РФ.